Laborationsdag 2

Under andra dagen av laborationen gjorde vi en PCR för att amplifiera  plasmidens DNA, därefter gjordes en gelelektrofores för att kunna se det templatet vi amplifierade och  samtidig påvisa att detta templatet var den genen som vi letade efter, d.v.s. LL-37 genen.

Bild av gelelektrofores på plasmidprep. resp. PCR-reaktion.

I första och sista brunnen (från vänster till höger) visas markör III, i brunn 2 markör IX, i brunn 3 positiv kontroll, i brunn 4 negativ kontroll, i brunn 5 den rena plasmiden och i brun 6 PCR-produkt. 

Som vi ser på bilden  lyckades  vi med resultatet eftersom vår PCR produkt bildar ett band i samma höjd som den positiva kontrollen , vilket indikerar att LL-37 gen finns. Positiva kontrollen innehåller LL-37 gen och därför kan vi säga att vi hittade genen LL-37.

Negativa kontrollen visar ingen band, vilket betyder att PCR amplifikat inte kommer från en carry-over kontamination.

Vid jämförelse av PCR produkten med markör IX ser vi att bandet i PCR motsvarar ca. 550 baspar. På det sättet konstateras också att templatet vi amplifierade är LL-37.

Efter alla dessa kontroller kan vi vara 100% säkra på att den genen vi hittade är LL37 gen.